Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Top3bQ9Z321 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top3bQ9Z321 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms