Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt27Q9Z320 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt27Q9Z320 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms