Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Knop1Q9Z2Q2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms