Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vamp5Q9Z2P8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms