Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mbd3Q9Z2D8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms