Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pdpk1Q9Z2A0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pdpk1Q9Z2A0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Pdpk1Q9Z2A0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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