Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccne2Q9Z238 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccne2Q9Z238 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms