Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trip6Q9Z1Y4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip6Q9Z1Y4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms