Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S5

Sept3, Neuronal-specific septin-3, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept3Q9Z1S5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sept3Q9Z1S5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sept3Q9Z1S5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sept3Q9Z1S5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sept3Q9Z1S5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sept3Q9Z1S5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Sept3Q9Z1S5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sept3Q9Z1S5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sept3Q9Z1S5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms