Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Sumo3Q9Z172 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Sumo3Q9Z172 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Sumo3Q9Z172 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Sumo3Q9Z172 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sumo3Q9Z172 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sumo3Q9Z172 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms