Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms