Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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MthfrQ9WU20 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MthfrQ9WU20 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MthfrQ9WU20 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MthfrQ9WU20 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MthfrQ9WU20 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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MthfrQ9WU20 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
MthfrQ9WU20 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
MthfrQ9WU20 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms