Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plod1Q9R0E2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms