Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plod3Q9R0E1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plod3Q9R0E1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms