Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vav3Q9R0C8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms