Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamc3Q9R0B6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms