Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nphs1Q9QZS7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Nphs1Q9QZS7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nphs1Q9QZS7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nphs1Q9QZS7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nphs1Q9QZS7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nphs1Q9QZS7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nphs1Q9QZS7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Nphs1Q9QZS7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nphs1Q9QZS7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nphs1Q9QZS7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nphs1Q9QZS7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Nphs1Q9QZS7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Nphs1Q9QZS7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nphs1Q9QZS7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Nphs1Q9QZS7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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