Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Usp21Q9QZL6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Usp21Q9QZL6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Usp21Q9QZL6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp21Q9QZL6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms