Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ndrg3Q9QYF9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms