Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
VapbQ9QY76 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
VapbQ9QY76 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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