Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdzd4Q9QY39 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdzd4Q9QY39 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms