Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Foxe3Q9QY14 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Foxe3Q9QY14 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Foxe3Q9QY14 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxe3Q9QY14 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms