Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpc5Q9QX29 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc5Q9QX29 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms