Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Homer2Q9QWW1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms