Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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