Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tnfrsf19Q9JLL3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms