Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col5a3Q9JLI2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms