Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tgm1Q9JLF6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Tgm1Q9JLF6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms