Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gde1Q9JL56 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms