Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uchl3Q9JKB1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms