Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc86Q9JJ89 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc86Q9JJ89 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc86Q9JJ89 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc86Q9JJ89 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc86Q9JJ89 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms