Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad9Q9JIW5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms