Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmod3Q9JHJ0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod3Q9JHJ0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms