Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn12Q9ET43 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cldn12Q9ET43 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn12Q9ET43 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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