Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mkrn2Q9ERV1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms