Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS9

Igdcc4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc4Q9EQS9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Igdcc4Q9EQS9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igdcc4Q9EQS9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms