Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SgshQ9EQ08 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SgshQ9EQ08 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms