Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr1Q9EPQ1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr1Q9EPQ1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr1Q9EPQ1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr1Q9EPQ1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr1Q9EPQ1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr1Q9EPQ1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr1Q9EPQ1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms