Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hmgn3Q9DCB1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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