Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smg9Q9DB90 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smg9Q9DB90 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms