Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Med27Q9DB40 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Med27Q9DB40 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Med27Q9DB40 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Med27Q9DB40 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Med27Q9DB40 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Med27Q9DB40 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Med27Q9DB40 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Med27Q9DB40 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Med27Q9DB40 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Med27Q9DB40 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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