Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Znf580Q9DB38 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Znf580Q9DB38 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf580Q9DB38 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Znf580Q9DB38 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf580Q9DB38 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Znf580Q9DB38 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Znf580Q9DB38 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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