Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prpf4Q9DAW6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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