Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms