Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smco2Q9DA21 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms