Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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