Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg7Q9D906 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms