Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl4Q9D8E6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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