Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Fip1l1Q9D824 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Fip1l1Q9D824 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms