Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp5Q9D7S9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp5Q9D7S9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms